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外泌体测序服务

外泌体miRNA测序、外泌体长链RNA测序、外泌体全转录组测序、外泌体蛋白组筛选和验证产品、定量蛋白组学筛选方法、修饰蛋白组学筛选方法、外泌体代谢组学检测、外泌体脂质组学检测及验证

 

外泌体miRNA测序
 

外泌体囊泡内含有丰富的miRNA ,研究表明,其与癌症、心血管疾病、免疫系统疾病等多种疾病密切相关。外泌体miRNA不仅可以参与生命活动的调控,也可以作为疾病的生物标志物,广泛应用于疾病诊断、个性化治疗 和预后等领域。基于Illumina高通量测序平台的small RNA测序技术,既能对外泌体miRNA进行鉴定及定量分 析,也能发现新的miRNA ,同时还可用生物信息学分析筛选在特定条件下差异表达的miRNA。

产品优势

外泌体miRNA研究中,由于传统分离外泌体方法无法有效去除杂蛋白,导致最终获得的miRNA会同时包含游离miRNA及囊泡来源的miRNA,因此得到纯度较高的外泌体miRNA是外泌体研究中的一项重要课题。

华然腾创从外泌体富集分离开始,保证高质量的外泌体输出,并在研究过程层层质控,选择最优的外泌体分离方式与建库方法,结合外泌体特征的分析算法,为客户个性化定制分析方案,为外泌体miRNA整体研究提供最优的解决方案。

准确度高,精确到单核苷酸水平,有利于区分高度同源的miRNA分子

测序深度高,保证测序结果的可靠性

灵敏度高,在表达量较低的样本中均可检测

采用多个外泌体囊泡数据库,注释信息更完整

采用多个数据库预测靶基因,结果更准确

 
 
外泌体长链RNA测序
 

外泌体囊泡内含有丰富的调节生命活动的长链RNA如mRNA,lncRNA等,研究表明,在不同的疾病模型中其长链RNA展现出不同的表达差异,有望成为液体活检的重要分子标志物,并揭示疾病发生的机理。采用去核糖体链的建库方法,对外泌体中mRNA,lncRNA等长链RNA进行测序,从而获得与特定生物学过程相关的RNA转录表达信息,促进疾病标志物、细胞生长于发育或调控机理等研究。

 

数据分析内容

 

产品优势

外泌体核酸研究中,有关长链RNA研究较少,主要原因是长链RNA占外泌体总RNA量较少,故而测序得到的长链RNA覆盖度低。此外,传统的采用低成本Oligo d(T)法富集mRNA的方式导致样品中的mRNA丢失Poly(A)尾巴从而无法被检测到,我们则采用特有的去rRNA链的方式建库,能极大程度地保留样品中的mRNA信息,尤其适用于临床样品的mRNA检测。

华然腾创从外泌体富集分离开始,保证高质量的外泌体输出,并在研究过程层层质控,选择最优的外泌体分离方式与建库方法,结合外泌体特征的分析算法,为客户个性化定制分析方案,为外泌体长RNA整体研究提供最优的解决方案。

 
 
外泌体全转录组测序
 

外泌体囊泡中含有丰富的RNA,包括miRNA以及长链RNA如mRNA、LncRNA等。研究表明外泌体RNA不仅可以参与生命活动的调控,也可以作为疾病的生物标志物,广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。对于外泌体RNA,分别进行基于Illumina高通量测序平台的small RNA建库和去rRNA链特异性建库,测定外泌体全转录组信息,从而全面地解读外泌体参与的生物学过程如细胞发育及疾病诊断等,有助于多层次、多方面地了解生物学过程。

 

数据分析内容    

miRNA+LncRNA

产品优势

外泌体miRNA研究中,由于传统分离外泌体方法无法有效去除杂蛋白,导致最终获得的miRNA会同时包含游离miRNA及囊泡来源的miRNA,因此得到纯度较高的外泌体miRNA是外泌体研究中的一项重要课题。

外泌体核酸研究中,有关长链RNA研究较少,主要原因是长链RNA占外泌体总RNA量较少,故而测序得到的长链RNA覆盖度低。此外,传统的采用低成本Oligo d(T)法富集mRNA的方式导致样品中的mRNA丢失Poly(A)尾巴从而无法被检测到,我们则采用特有的去rRNA链的方式建库,能极大程度地保留样品中的mRNA信息,尤其适用于临床样品的mRNA检测。

华然腾创从外泌体富集分离开始,保证高质量的外泌体输出,并在研究过程层层质控,选择最优的外泌体分离方式与建库方法,针对小片段RNA及长链RNA采用不用的建库方式,结合外泌体特征的分析算法,为客户个性化定制分析方案,为外泌体RNA整体研究提供最优的解决方案。

 
 
 
外泌体蛋白组学筛选和验证产品
 

采用不同的蛋白定量技术,如Label-Free Quantification非定量蛋白组学技术、TMT/iTRAQ标记定量蛋白组学技术和DIA定量蛋白组学技术等,对不同来源外泌体中的总蛋白或特定修饰蛋白(如磷酸化、泛素化等)进行相对或绝对定量,筛选并验证疾病发生发展、预后、免疫调控及诊断等方面的蛋白标志物分子。

 

技术流程

蛋白质非标记定量技术(Label-Free Quantification)是通过液质联用技术直接对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-FreeQuantification的技术优势就在于无需对蛋白质预先使用昂贵的同位素标签进行标记,所需样品总量少,耗费低。轻松实现蛋白的相对定量,用于复杂体系中生物标志物的筛选

定量蛋白组学筛选方法
 

Label-Free Quantification

蛋白质非标记定量技术(Label-Free Quantification)是通过液质联用技术直接对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-FreeQuantification的技术优势就在于无需对蛋白质预先使用昂贵的同位素标签进行标记,对样本的操作较少,并且不受样品条件的限制,所需样本量低,耗费低,可以检测到的肽段动态范围可以达到4个数量级以上,提高了低丰度蛋白质的检测效率、非标记定量准确性。轻松实现蛋白的相对定量,用于复杂体系中生物标志物的筛选。

 

TMT/iTRAQ

基于质谱的TMT/iTRAQ标记技术可以快速、轻松实现蛋白的相对定量,用于复杂体系中生物标志物的筛选。TMT/iTRAQ标记试剂盒是比较正常、疾病以及药物治疗后样本间的表达差异,研究时间进程中的蛋白变化,比较生物重复间的不同以及提供蛋白相对定量的理想工具。

 

DIA

DIA定量蛋白组学技术:DIA(Data-Independent Acquisition,数据非依赖性采集)是一种无歧视性和无随机性的蛋白质组分析技术, 将质谱全扫描范围分为若干个窗口,然后对每个窗口中的所有离子进行检测、碎裂,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的信息, 降低样本检测的缺失值,同时提高定量准确性和重复性,实现大样本队列中高稳定,高精准的蛋白质组定量分析。

 
 
修饰蛋白组学筛选方法
 

磷酸化蛋白组学

磷酸化蛋白质组(Phosphoproteome)就是蛋白质组中全部的磷酸化蛋白质,而磷酸化蛋白质组学(Phosphoproteomics)就是针对磷酸化蛋白质的全面分析,包括对磷酸化的鉴定、定位和定量。可使用固定金属离子亲和色谱法(IMAC)和二氧化钛亲和色谱法(TiO2)对磷酸化蛋白组进行富集,再使用质谱进行检测。

 

泛素化蛋白组学

泛素化蛋白质组学利用对泛素化赖氨酸残基(K-GG)具有高亲和力的基序抗体,特异性富集复杂样本中的泛素化肽段,结合LC-MS/MS蛋白质定量方法,可实现大规模泛素化蛋白质定性定量分析。

产品优势

在外泌体蛋白研究中多数分离方法无法有效的去除样本中的杂蛋白,尤其血浆样本,主要的集中血浆蛋白如球蛋白ITH2、血蛋白ALB、F2蛋白、补体蛋白C4A可占据最终总蛋白的90%以上,导致鉴定出的外泌体总蛋白数量少,无法满足研究需要。因此在外泌体蛋白研究时要求获得的外泌体纯度高,杂蛋白去除效率高。

华然对于综合技术不断优化,结合不同的外泌体和蛋白的纯化方法,可以做到从源头上严格质控,可做到高标准高质量高通量的产出。

 
 
 
 
外泌体代谢组学检测
 

代谢组学(metabolomics/metabonomics)是继三大组学(基因组学,转录组学和蛋白质组学)后出现的新兴组学,并已广泛用于新药研发、疾病诊断、个性化治疗等领域。在基于基因组-转录组-蛋白质组-代谢组的系统生物学框架内,代谢组学处于最下游,最接近生物表型,主要通过考察生物体系在某一特定时期内受到刺激或扰动前后所有小分子代谢物 (分子量小于 1500 Da) 的组成及含量变化,寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。华然腾创在优良的外泌体提取方案基础上,可以提供全方位的、可靠的外泌体代谢组学检测和靶向验证检测,用于疾病诊断及预后的生物标志物寻找、研究疾病的发生发展机制、治疗的靶点寻找以及治疗手段的创新。

 

服务项目

 

产品优势

1.全谱代谢组 检测样本中所有代谢物,寻找不同组别之间的差异代谢物

2.非靶向代谢组  全面覆盖不同性质代谢物,比普通非靶有更高的数据量

3.广泛靶向代谢组学 结合非靶技术⾼分辨、⼴覆盖的优势与靶标MRM技术的⾼灵敏度、精确定量能⼒

4. TM广靶代谢组 整合非靶向和广泛靶向代谢物检测技术优点,实现了高通量、高灵敏、广覆盖。

5. T500定量代谢芯片 T500可对能量代谢、氧化脂质、脂肪酸代谢、胆汁酸代谢、色氨酸代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢、神经递质、类固醇激素9大通路的650+物质进行绝对定量检测

 

推荐检测

 

外泌体脂质组学检测及验证
 

脂质组学是指通过对生物体内的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定,了解脂质的结构和功 能,进而揭示脂质代谢对机体生理病理状态的调控作用。在所有种类的细胞外囊泡中,外泌体具有较高的脂蛋白 比。不同来源的外泌体,其膜结构中的脂质组成是有选择性的。外泌体脂质组学分析不仅可以帮助我们了解囊泡的 生物发生和功能,鉴定基于脂质的新型生物标志物,揭示其在疾病中的监测功能,而且对于外泌体载药能力评估和 生物活性分析等基础研究也具有指导意义。

 

实验流程

 

检测列表

 

应用方向

  1.临床疾病研究:应用于心血管、肿瘤、免疫、内分泌、消化系统、神经系统等各类疾病研究;

2.生物标志物研究:通过研究不同组间的脂质谱差异,筛选生物标志物,可用于疾病诊断、疾病分期/分型、预后判断等方面的研究;  

3.生理病理机制研究:研究机体生理和病理作用,如脂质对生长、发育、能量代谢、信号转导过程以及对疾病的影响,阐明影响疾病健康的重要脂质的调控基因以及调控机制;

4.药物作用机理研究:如聚酮类抗微生物、抗寄生虫和抗肿瘤药物;

5.多组学联合研究:与其他组学结合,揭示相关的分子生物学作用机制,获得更完整的生命图谱。